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UMR CNRS 5805 EPOC
Environnements et Paléoenvironnements
Océaniques et Continentaux
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Consignes de Sécurité et Numéros d'Urgence
(à l'usage des personnels du laboratoire)
EA : Outils

Technicité

En termes de risques environnementaux, nous sommes spécialisés dans :
- La contamination expérimentale du vivant par les métaux traces (Cd, Zn, Cu, Hg, Pb, Mn), dans l'eau ou la nourriture, et les interactions avec les facteurs environnementaux comme la physico-chimie de l'eau, le plancton, etc...,
- La physiologie respiratoire (écophysiologie), la gestion d'O2 et de CO2 chez l'animal aquatique (crustacés, mollusques poissons),
- Les faibles, ou relativement faibles, concentrations de métaux (différence entre toxicologie et écotoxicologie),
- Les expositions à moyen et long termes en laboratoire,
- La comparaison laboratoire / terrain,
- La caractérisation de flux de contaminants le long d'une chaine trophique,
- Le développement de méthodes de « caging » raisonné,
- Les technologies faible stress en expérimentation animale,
- Le développement de bioessais pour l'évaluation de la toxicité des contaminants
- L'utilisation de bioessais pour la mesure du potentiel toxique de substances pures ou en mélange ou encore d'échantillons environnementaux
- L'utilisation de biomarqueurs biochimiques et cytométriques pour la mesure des effets des polluants
- la mesure de l'intégrité génétique (test des comètes et test des micronoyaux).
- Le criblage haut débit par des lignées cellulaires
- Le dosage des hormones stéroïdes
- Les analyses comportementales
- Le développement de nouvelles technologies.
Matériel

- Salles de stabulation et d'élevage pour les espèces aquatiques, dont trois climatisées : algues planctoniques et périphytiques (Chlorophycées et Diatomées), macrophytes enracinées (élodées), larves d'insectes intra-sédimentaires (Hexagenia rigida), oligochètes (Tubifex) et bivalves filtreurs (corbicules, moules zébrées, huîtres, coques), crustacés (écrevisses, crabes), poissons (cyprinidés),

- Animalerie aquatique pour l'élevage du poisson médaka japonais (Oryzias latipes) avec un système Zebtek Tecniplast®, aquariums et une salle d'embryotoxicité pour les embryons et larves de médaka et de truites (Oncorhyncus mykiss) avec enceintes thermorégulées (photopériode jour/nuit), microsonde pH (Hanna) et fibre optique (Presen) pour la mesure de l'oxygène, , loupe binoculaire avec système d'analyse d'images (Leica),

- Salles d'expérience avec systèmes automatisés de régulation des facteurs abiotiques (température, photopériode, pH, intensité lumineuse) - Centrale de régulation du pH: SN5510, AOIP - Microcosmes : 8 enceintes de régulation, permettant chacune la mise en place simultanée de 8 ou 32 unités expérimentales (256 ou 64 unités : 12x12x30 cm ou 24x24x30 cm) - Mésocosmes : 10 enceintes (70x80x100 cm),

- Deux salles d'expérience climatisées, comprenant : pH-mètres, CO2-stat, cryostats Haake, centrale à eau glacée, programmateur de séquence pour expérimentations automatisées, débitmètres Tylan pour le contrôle des gaz dans l'eau,

- Salle de culture et d'analyse cellulaire, comprenant : PSM II (Thermo), 2 incubateurs à CO2 (Thermo et Newbrunswick), 1 cytomètre en Flux (Attune Life Technologie), 1 microscope inversé Euromex, 2 lecteurs de microplaques (BMG Labtec, Elisa Dynatech), 1 centrifugeuse (Dynac), 1 Vacusafe (IBS), un autoclave (SYStec),

- Salle de culture et d'analyse microbiologique , comprenant : PSM II (Thermo), 1 incubateur agitant (Newbrunswick), 1 lecteur de microplaque Synergy Biotek, 1luminomètre Microtox OMNI®, 1 microscope Leica

- Equipements pour l'analyse physico-chimique des milieux : pHmètres (BIOBLOCK), oxymètres (OXI 100), conductimètre (HANNA), turbidimètre (model 800, ESD), équipement automatisé pour l'analyse des anions et cations par Chromatographie ionique (Dionex : DX 100, passeur d'échantillon automatique, logiciel PEANET), spectrophotomètre UV 160 Shimadzu ; photomètre de flamme Ependorf ; analyseur O2 Servomex ; analyseur CO2 Servomex ; Po2-mètres ; Sytème de mesure optiques - optodes - pour la mesure de l'activité de l'oxygène ; osmomètre Wescor ; Chloridomètre Radiometer ; poste de titration Radiometer ; analyseur de contenus en O2 et CO2 ; Blood Micro System Radiometer; chambre à diffusion plus spectrophotomètre ; ensembles de pompes Wösthoff et de débitmètres massiques Tylan et Brooks ; centrifugeuse Heraeus ; collecteur de fraction ; station d'analyse automatique Grant/Ysi ; Fluorimètre Turner Design 10AU-072,

- Equipements pour le dosage des métaux :
- Dosage des métaux (Cd, Zn, Pb, Cu, Au, Mn,...) par absorption atomique par flamme. Marque VARIAN, modèle AA220FS.. Analyse simultanée des 4 métaux en 30 secondes sur minéralisats. Limite de détection voisine du µg g-1 sur 5 mL d'échantillon minimum,
- Dosage des métaux (Cd, Pb, Au, Mn,...). Absorption atomique par four. Marque Thermo Opteck, modèle M6 SOLAAR. Analyse des métaux en 10 minutes sur minéralisats. Limite de détection voisine du ng g-1 sur 1 mL d'échantillon minimum,
- Dosage du mercure total par Absorption atomique. Marque : Courtage Analyse Service : AMA 254, 2 appareils. Analyse du métal en 10 mn sur matière sèche. Limite de détection : 0,01 ng,
- Dosage du monométhylmercure (MMHg) dans les organismes à partir de la méthode Bloom. Cette méthode se compose de plusieurs séquences analytiques : après solubilisation en milieu alcalin, une éthylation rend volatile le MMHg, le composé est alors piégé sur un support absorbant « Ténax », puis après chauffage, élué par chromatographie gazeuse, pyrolysé à 800°C et enfin détecté par fluorescence atomique. La limite de détection est de 0,001ng,
- Système de minéralisation des échantillons : bloc de graphite (54 puits). Marque Courtage Analyse Service, Hotblock. Autoblock.

- Equipements pour le dosage des contaminants organiques :
- Chromatographie Liquide Haute Performance et équipements annexes : chaîne CLHP (HP 1050) avec détecteur UV ; chaîne CLHP Perkin-Elmer avec détecteur de fluorescence,
- Chromatographie en Phase Gazeuse avec détecteur à capture d'électrons (HP 5890, série II plus - ECD 63Ni).

- Equipements pour l'analyse biochimique des protéines : Ensemble gradiant binaire basse pression pour Chromatographie sur gel filtration et sur échangeur d'ions (Gilson : collecteur de fractions, détecteur UV, 3 pompes péristaltiques),

- Equipements en Biologie moléculaire/Génétique :
- Centrifugeuses Mini-Spin (Eppendorf),
- Centrifugeuse réfrigérée S5417R (Eppendorf),
- Système de production d'eau «ultra pure» Purelab DV25 (Elga),
- Table UV (Eppendorf),
- Appareils de PCR Eppendorf Master Cycler et Eppendorf AG,
- Appareils de PCR quantitative MX3000P (Stratagène) et Lightcylcer (Roche),
- LuminomètreLB 9507 (Lumat),
- Spectrophotomètre UV1601 (Shimadzu),
- HPLC série 1050 (Hewlett packard),
- Electroporateur 2510 (Eppendorf),
- Mini four à hybridation Avantec,
- Sécheur de gels Biorad,
- Matériel d'électrophorèse Biorad,
- Chambre de culture à agitation orbitale S150 (Stuart scientific).

- Equipement d'histologie : Photomicroscopes optiques (Olympus BX50 et Leitz orthoplan), équipement pour la préparation des échantillons/grilles pour observation en microscopie électronique, Microtome Leica

- Poste d'analyse d'images vidéo : 1 microscope Olympus BX51 à épifluorescence, 2 loupesbinoculaires Leica MZ12 et MZ75, 1 microscope inversé NIKON Eclipe5100, 1 microscope Leica DM 2000, 1 mesureur interactif Leica (logiciel, ordinateur, accessoires), 4 caméras NetB (Sony, Nikon DS FI2, Perceptive instrument), et couleur (Sony, Leica DFC295 et 420C), 1 caméra Watec N&B,

- Equipement pour l'analyse du comportement animal : 2 anneaux de nage diamètre 2 m ; 2 anneaux diamètre 40 cm ; Valvomètres de terrain : 5 ; valvomètres de paillasse, 3 ; Station de travail Dell double corps Xeon, 2 systèmes Ethovision/Daniovision Noldus avec système de contrôle de température pour l'analyse du comportement des larves de poisson

- Equipements de base : Spectrophotomètres visible (SAFAS, Easyspec IV, UVIKON, Beckmann) - Centrifugeuses réfrigérées (Sigma 3K12, Sigma 1-15K, eppendorf 5810R) - Production d'eau distillée (Distinction BIBBY, ELGA Veolia), production d'eau ultra-pure (MilliQplus, Maxima Veolia) - Cuve à ultra-sons (88155 BIOBLOCK, Advantage lab) - Broyeurs ultra-turrax (T25, IKA) - Evaporateur rotatif (94200, Heidolph, IKA) - Evaporateur /Concentrateur (speedvac Savant)- Bain-Marie réfrigérant polystat71 Huber- 1 chambre froide - 5 balances de précision (Sartorius) - 6 étuves (Memmert) -2 congélateurs -80°C (NAPCO UF 400, Cryonex)...

- Equipement informatique : micro-ordinateurs (Dell), micro-ordinateurs (HP), 4 imprimantes lasers, scanners, appareils photo numérique Nikon, video-projecteurs. PC portable de terrain,

- Ateliers de mécanique et d'électronique

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